Plongée dans l'Oligoprojet

Qu'est-ce que l'Oligo ?

L'expression du matériel génétique passe de l'ADN à l'ARN, puis aux protéines. Au cours du siècle dernier, les efforts visant à développer de nouveaux médicaments se sont principalement concentrés sur le ciblage des protéines à l’aide de différents types de composés, notamment des petites molécules et des anticorps monoclonaux. Dans ce cadre, le médicament influence le fonctionnement d’une ou plusieurs protéines spécifiques. Cependant, tous les types de protéines ne peuvent pas être traités à l’aide de cette stratégie.

Une alternative à cette approche classique consiste à moduler l’ADN ou l’ARN. Cela peut être réalisé à l’aide d’oligonucléotides. Les oligonucléotides sont de petits polymères d'acides nucléiques synthétiques, à simple ou double brin (≈20 ou plus), dont la séquence est connue. Si cette séquence est complémentaire d’un segment donné d’ADN ou d’ARN – on parle alors d’oligonucléotide antisens –, elle peut alors former un duplex avec celui-ci et ainsi inhiber l’expression génique. De cette manière, elle influence le fonctionnement de la protéine.

Un tel processus d’oligonucléotide comprend les étapes suivantes :

1. Synthèse: il s’agit de la synthèse chimique de fragments relativement courts d’acides nucléiques présentant une structure chimique (séquence) définie. Pour obtenir l’oligonucléotide souhaité, les éléments constitutifs (amidites) sont couplés séquentiellement à la chaîne d’oligonucléotides en cours de formation, dans l’ordre requis par la séquence du produit. Cette synthèse s’effectue dans une colonne remplie d’un support.
2. Clivage et déprotection: Une fois la séquence terminée, le produit est séparé de la phase solide (= support), transféré dans une solution, déprotégé puis recueilli
3. Purification: cette solution brute d’oligonucléotides est ensuite séparée des impuretés par chromatographie
4. Ultrafiltration / Diafiltration (UFDF): cette étape permet d'éliminer les sels des oligonucléotides et de les concentrer davantage
5. Hybridation: au cours de cette étape facultative, il est possible de passer d’un oligonucléotide simple brin à un oligonucléotide double brin par hybridation
6. Lyophilisation: enfin, l'excès d'eau est éliminé par lyophilisation, ce qui permet d'obtenir le produit final

Modernisation du Centre d’excellence en oligonucléotides

Afin de pouvoir produire en interne des oligonucléotides adaptés aux lots toxicologiques ou à la production clinique « First In Human » (FIH), Janssen Pharmaceutica a décidé de moderniser son Centre d’excellence en oligonucléotides et de l’équiper de matériel conforme aux normes cGMP. L'objectif de ce centre est d'étendre les capacités et les compétences internes afin de garantir une livraison ponctuelle et fiable des produits cliniques et de développer de nouveaux procédés.

Fit For Purpose

Étant donné que ce processus est exclusivement axé sur des fins FIH, il a été décidé d’opter pour une approche de qualification « allégée », l’approche « Fit For Purpose » (F4P). L’accent est principalement mis sur l’exploitation maximale des tests FAT/SAT/mise en service, l’absence de séparation stricte entre les différentes phases de qualification, ainsi que la réduction des revues et des validations par l’assurance qualité. Cela permet d’accélérer le déroulement de la qualification et de réduire considérablement la paperasserie et la documentation.

Contribution d’Advipro

Afin de mener à bien ce projet d’envergure aux délais ambitieux, l’aide d’Advipro a notamment été sollicitée. L’équipe A s’est chargée du volet conformité, tant pour les équipements, les services et les installations que pour les systèmes d’exécution (CSV).

Lien - Équipements

Mon rôle au sein du projet s’est d’abord concentré sur le volet « équipements » du projet. De nombreux fûts mobiles, réacteurs, skids, etc. devaient être achetés, testés et qualifiés. J’étais responsable de :

1. La fourniture de tous les documents de qualification (URS/IA, protocoles, rapports, etc.). Ceux-ci ont été rédigés sur la base de l’approche « Fit For Purpose » expliquée précédemment. Le principal défi consistait ici à définir ce qui était admissible ou non dans le cadre de l’approche «Fit For Purpose», car il s’agissait d’une nouveauté pour tous les membres de l’équipe de projet.
2. La rédaction du contrôle des modifications global et des différents contrôles des modifications spécifiques à chaque équipement. Cela impliquait également la coordination, la révision et le traitement de toutes les actions de contrôle des modifications (plus de 1 000 actions).

En tant que « dernière femme en lice », ma mission consiste actuellement à finaliser l’ensemble du volet conformité du projet Oligo, c’est-à-dire à la fois les équipements, les services et installations, ainsi que les systèmes d’exécution.

Rani - Services et installations :

Au sein du projet, j’ai commencé par assister Lien dans la rédaction des documents de qualification sur la base des essais de conformité des équipements (Fit For Purpose Equipment Testing). Je me suis rendue à plusieurs essais de réception en usine (FAT) aux Pays-Bas pour les cuves mobiles utilisées lors des différentes étapes de la production d’oligonucléotides. Mes tâches consistaient à vérifier la documentation et à effectuer quelques tests fonctionnels. Après une brève période consacrée au volet « Équipements », j’ai dû me concentrer entièrement sur le volet « Services et installations » de ce projet, pour lequel une qualification classique devait être réalisée. J’étais chargée de :

1. La rédaction de tous les documents de qualification (URS, IA, protocoles de qualification et de sécurité, rapports de qualification et de sécurité, etc.) selon les deux méthodes différentes des deux services responsables au sein de Janssen Pharmaceutica.
2. La mise en place des contrôles de changement spécifiques aux « Utilities & Facilities »
3. Le suivi et la coordination de la fourniture des justificatifs relatifs à ces actions de contrôle des changements

Ce projet m’a permis d’affiner mes compétences en matière de coordination, car j’ai dû communiquer avec différents prestataires, les différents services au sein de J&J, etc.

Kristof - Systèmes d’exécution

En tant qu'ingénieur conformité, je me suis principalement occupé du volet « automatisation » du projet. C'est là que j'ai découvert tout ce qui touche aux systèmes d'exécution, aux automates programmables (PLC), à l'intégrité des données, etc. Pour Oligo, on a spécifiquement utilisé PCS7, le système de contrôle des processus chargé, entre autres, de la surveillance, de la visualisation et (dans certains cas limités) du contrôle direct des équipements. PCS7 était impliqué dans les contrôles de modification de nombreux systèmes, ce qui rendait la tâche très complexe. Une validation complète était nécessaire pour PCS7. J’ai participé à toutes les étapes, de la revue de conception jusqu’aux tests fonctionnels. Je me suis principalement occupé de la documentation, notamment de la rédaction d’un URS, d’un RA et d’un IOQP. J’ai également eu l’occasion de réaliser moi-même plusieurs tests fonctionnels liés à l’intégrité des données.

Sara - Cheffe de projet

Au cours du projet Oligo, j’ai été la première personne de Normec Advipro à rejoindre le projet. J’ai participé à la rédaction du plan de qualification du projet et à la définition de l’approche à suivre en matière de conformité au sein du projet. Après la mise en place de l’équipe, j’ai progressivement transféré mes tâches à l’équipe. Au sein du projet, j’étais responsable de la planification globale des tâches de conformité et du budget de l’ensemble de l’équipe Advipro A. Du côté de Normec Advipro, nous avons toujours fait preuve de flexibilité pour fournir les ressources dont le projet avait besoin. De plus, j’ai surveillé la charge de travail de l’équipe et suis intervenu lorsque cela était nécessaire.

Et comment Janssen Pharmaceutica a-t-elle vécu cette collaboration avec une équipe de classe A ?

« Il y avait un véritable esprit d’équipe au sein de Normec Advipro et une intégration rapide dans l’équipe de projet. Ce fut un parcours passionnant au cours duquel l’équipe a su mobiliser ses ressources avec souplesse et a assuré une livraison dans les délais ainsi qu’un suivi de qualité de la documentation. La gestion de projet était parfaitement assurée par cette équipe motivée ! »

- Jurgen Verbraeken, ingénieur principal senior